■概要

今回発表する『Sedue Flex』は、ゲノムや音声データなどの検索に必要とされ
る「曖昧全文検索」を、最新のアルゴリズムを利用することにより高速に処理
可能な検索エンジンです。本検索エンジンを利用することにより、従来であれ
ばスーパーコンピュータ級の処理能力を必要としていたゲノム解析などを１台
～数台のPC上で高速に処理することが可能です。

■特徴

『Sedue Flex』は、弊社が開発した全文検索技術『Sedue』をベースにし、文
字列の欠落やミスマッチありの場合でも高速検索を可能にした全文検索エンジ
ンです。本エンジンでは、10%～20%の誤りを許した全文検索を、ギガバイト級
のデータに対しても数ミリ秒～数秒のオーダーで検索することが可能です。

今回開発したエンジンは、どのような長さの文字列に対しても曖昧検索を可能
にしているため、従来手法では実現できなかった高度なゲノム解析処理やノイ
ズを含んだデータに対する検索を実現可能にしています。特に、ゲノム解析に
おいては従来手法では困難であった、５０塩基程度の短い長さの塩基配列に対
するミスマッチあり（一部の文字が異なる）・ギャップあり（一部の文字が欠
落・追加している）の検索も可能です。

本エンジンに利用している「圧縮全文索引」方式は、従来の検索方式では扱う
ことが難しい任意長の長さの文字列に対しても、非常に高速に検索を行うこと
が可能です。その技術と今回新たに開発した曖昧検索アルゴリズムを融合する
ことにより、従来ではスーパーコンピュータ級の性能が必要であった検索処理
を、１台のPCで実現することが可能になっています。

■用途・動作環境

本エンジンは、
・ゲノム解析
・ノイズの含まれたデータに対する検索
などの高速・高度な曖昧検索機能を必要とするユーザーを対象にしています。

Sedue Toolsが動作する環境は、Linux(Fedora Core 4/5/6及びCentOS 3/4で動
作確認済み)となります。

＜本件に関するお問い合わせ先＞
Mail:info@preferred.jp
URL:http://preferred.jp/sedue/